科学推理也是科学论证的重要组成部分。科学推理其实就是借助探究时掌握的原始数据，给自己的假设寻找一个解释的理由。科学论证可以促使学生深度思考，由现象看到本质，由现象推理解释。学生思维深度发展的过程，从看到的现象进行推理，善于抽象思维，逻辑性强，能用自己的语言具体形象描述从亲自探究中发现的现象，再进行推理，思维不断深入，能归纳概括，从一般现象上升到普遍规律，从而认识事物的本质与规律性。学生在探究中继续发现磁极的作用，并且用不同方法验证自己的假设，组合小车磁极的不同部位，中间靠中间，红色靠红色，蓝色靠蓝色，蓝色靠红色，竖着靠近，横着靠近。虽然有些磁铁靠近方式换个角度看是一样的，但对于二年级学生来说，他们已竭尽所能地思考，尽可能地进行多种排列组合，不错过任何一种，以求结果的准确。学生在探究论证过程中发现，小车的同色异色互相靠近，呈现不同的结果，也就是同极相斥，异极相吸。
这时的学生还只是关注到这一现象，得到这一证据，在脑海中还没形成科学知识和概念。但学生因为有了前面科学论证的铺垫，学会了把数据分类整理，归纳总结，通过互相交流，思维碰撞，从而归纳推断出磁铁都有同极相斥异极相吸这样一个现象，至此科学概念在他们合理的解释中形成。学生的思维经历了一个猜想设计探究验证的科学过程，这样的求证过程让学生思维得到全面启动，深度挖掘，积极性高涨，效果明显。学生小心求证，大胆推理的过程就是科学论证促进科学思维发展的过程。